可以单独缴纳。根据中国公积金中心的规定，个人无法自行缴纳和办理住房公积金，必须由职工所在的单位代为缴纳。当公司为员工缴纳住房公积金时，必须准备员工的身份证复印件、个人公积金账户的交易明细、登记表以及其他所需材料。

住房公积金管理中心应在指定银行设立住房公积金专户。单位需要到住房公积金管理中心办理住房公积金缴存登记，并经管理中心审核后，到指定银行为员工办理住房公积金账户设立手续。每个员工只能有一个住房公积金账户。住房公积金管理中心应建立员工住房公积金明细账户，记录员工个人住房公积金的缴存和提取情况。住房公积金的特点是普遍适用的，城镇在职员工，无论工作单位性质、家庭收入高低以及是否已拥有住房，都必须按规定缴存住房公积金。

法律依据：《住房公积金管理条例》第三十七条。违反本条例的规定，单位不办理住房公积金缴存登记或者不为本单位职工办理住房公积金账户设立手续的，由住房公积金管理中心责令限期办理；逾期不办理的，处1万元以上5万元以下的罚款。

公积金账户余额能做首付吗？

不可以。公积金的使用原则是"先消费后提取"，即只有在购房后才能提取公积金。

如果购房是通过贷款进行的，职工可以凭借借款合同的原件及复印件、购房合同的原件、首付款发票的原件及复印件等材料办理公积金提取手续，以缓解购房首付款和月还款的压力。如果借款人购买的是政策性住房，例如经济适用住房、廉租房、集资合作建房等，可以一次性申请将职工个人账户内的住房公积金转入个人储蓄账户，用于支付购房首付款。许多人认为公积金是职工购房的福利政策，理所当然地可以用来支付购房首付款。